More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1386 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  100 
 
 		 344 aa  713    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  67.44 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  31.44 
 
 		 353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0912  integrase family protein  30.4 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  31.59 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  27.27 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  31.07 
 
 		 365 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.24 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.41 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.62 
 
 		 370 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.81 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.89 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  30.2 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  22.01 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.28 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  23.47 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  25.22 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.63 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.99 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  21.39 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.47 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  23.21 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.55 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  22.6 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  25 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.92 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.36 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.92 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  21.93 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  26.39 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  29.58 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  22.54 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.8 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.3 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  27.78 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  25.35 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  26.46 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  26.46 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.65 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  22.78 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.01 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.33 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  21.87 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  23.4 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  30.63 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  27.85 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.25 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  29.76 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  23.38 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  22.25 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  26.15 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  24.92 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  21.36 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  22.76 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  22.36 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  22.55 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.09 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  22.13 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  23.32 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  22.98 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.66 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.19 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.77 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  30.34 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.34 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.11 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  29.27 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  30.37 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.72 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  30 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.21 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  22.73 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  20.99 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1394  integrase family protein  22.77 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.71 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.54 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  26.07 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  20.66 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  22.53 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>