More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1355 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
303 aa  633  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
316 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 
287 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
295 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
300 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 
1201 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  21.63 
 
 
285 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  22.3 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  27.82 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
353 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  31.96 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  22.57 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  28.44 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
462 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  27.34 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  27.34 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  27.27 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  33.33 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  33.64 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  24.32 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.37 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  27.83 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  22.08 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  22.3 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  28.43 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  25.76 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  28 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  29.41 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5450  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 
360 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 
196 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000257264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  27.68 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  31.68 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  28.57 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  20.83 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
372 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>