49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1317 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1317  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
135 aa  256  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1345  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00066539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1067  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
264 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.9 
 
 
758 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
566 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1341  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.44 
 
 
884 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3080  metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 
486 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.03 
 
 
668 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 
534 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
750 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.31 
 
 
878 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
245 aa  42  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0605  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00129265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0848  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
469 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 
265 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
1486 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
605 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
466 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
3301 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3172 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
762 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
4079 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
750 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
1421 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
285 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20251  hypothetical protein  32.5 
 
 
573 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.625545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.61 
 
 
818 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.1 
 
 
746 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.71 
 
 
452 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  26.15 
 
 
451 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
288 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 
810 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  28.57 
 
 
612 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
285 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
215 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
833 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
292 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>