17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1316 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000132332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  29.29 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  28.86 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1410  hypothetical protein  35.77 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  29.09 
 
 		 339 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  27.87 
 
 		 332 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 332 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2307  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 		 328 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  30.21 
 
 		 335 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1441  hypothetical protein  26.05 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  27.18 
 
 		 306 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4657  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 142 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>