More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1125 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 408 aa  828    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  61.27 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  44.03 
 
 		 447 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  46.57 
 
 		 416 aa  348  8e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  43.94 
 
 		 447 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 441 aa  345  7e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  41.82 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  47.04 
 
 		 431 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  43.06 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.56 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 457 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  44.63 
 
 		 447 aa  334  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  43.02 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  42.56 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  45.07 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  40.79 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  41.69 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  45.02 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  43.33 
 
 		 457 aa  326  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  41.35 
 
 		 459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  40.09 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 435 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  41.23 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 449 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  43.84 
 
 		 528 aa  323  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  43.15 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  39.86 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  43.53 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  41.83 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  42.39 
 
 		 485 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  42.07 
 
 		 454 aa  318  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  41.02 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  42.3 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  42.4 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  42.76 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  43.22 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  44.44 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  45.69 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  41.73 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  42.69 
 
 		 443 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  41.61 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  41.15 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  42.04 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  41.09 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  42.65 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.43 
 
 		 739 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  42.55 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  41.19 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  43.51 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  41.39 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.33 
 
 		 731 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  37.92 
 
 		 463 aa  305  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  43.23 
 
 		 419 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  41.01 
 
 		 448 aa  305  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 		 437 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  40.51 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.04 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  40.97 
 
 		 396 aa  302  6.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  40.95 
 
 		 455 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  41.85 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  41.08 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.31 
 
 		 721 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  45.07 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  43.14 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  41.97 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  41.19 
 
 		 427 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  44.09 
 
 		 429 aa  299  5e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  41.45 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  39.28 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  41.11 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  41.92 
 
 		 441 aa  298  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.49 
 
 		 726 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  38.74 
 
 		 519 aa  296  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  40.53 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 		 423 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.79 
 
 		 599 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.67 
 
 		 733 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  41.69 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  41.46 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  40.53 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  42.53 
 
 		 544 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  37.5 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  38.33 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  39.23 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  37.32 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  40.57 
 
 		 429 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  38.55 
 
 		 441 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.05 
 
 		 599 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  39.08 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  39.05 
 
 		 443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>