More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1100 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  100 
 
 
364 aa  748    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  46.69 
 
 
311 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  45.98 
 
 
345 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  43.53 
 
 
351 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  41.76 
 
 
348 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  42.58 
 
 
350 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  40.27 
 
 
347 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  40.27 
 
 
347 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  40.11 
 
 
357 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  41.76 
 
 
337 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  43.31 
 
 
347 aa  263  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  39.31 
 
 
356 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  41.95 
 
 
353 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  40.12 
 
 
341 aa  260  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  40.86 
 
 
348 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  41.55 
 
 
348 aa  256  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  40.95 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  39.94 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  37.68 
 
 
354 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  41.02 
 
 
352 aa  247  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
346 aa  245  8e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  37.32 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  37.64 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  39.13 
 
 
345 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  36.07 
 
 
344 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  37.69 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  35.48 
 
 
323 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  39.33 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 
370 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 
352 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 
360 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  35.87 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
374 aa  193  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  32.08 
 
 
351 aa  186  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  34.64 
 
 
359 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  33.66 
 
 
359 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  31.86 
 
 
359 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  26.15 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  24.53 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  26.14 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  25.64 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  26.6 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  26.6 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  25.51 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  25.82 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.9 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.28 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.91 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.86 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  25.49 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  26.52 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  25.93 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  24.76 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.41 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.86 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.75 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.18 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  23.9 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.5 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  24.92 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  23.96 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.94 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  26.2 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  24.12 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  24.92 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  24.92 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  24.92 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  24.92 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.89 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  24.92 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.55 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  24.58 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  27.16 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  21.9 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  25.83 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  24.58 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  25.8 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  24.32 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  26.16 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.68 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  24.58 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  25.98 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.6 
 
 
470 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  21.43 
 
 
472 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  23.05 
 
 
341 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  23.55 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.46 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  22.59 
 
 
474 aa  63.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.43 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.9 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.46 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.98 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  25 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.43 
 
 
489 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.44 
 
 
374 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.89 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.12 
 
 
458 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>