223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1069 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
316 aa  626  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  66.03 
 
 
313 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  46.96 
 
 
308 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  35.31 
 
 
315 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  35.31 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  35.31 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  35.96 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  31.65 
 
 
327 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  30.79 
 
 
334 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 
321 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
310 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  33.33 
 
 
310 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
315 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  32.38 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  32.7 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  32.7 
 
 
313 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  32.7 
 
 
362 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  32.7 
 
 
310 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 
310 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.33 
 
 
315 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
317 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  32.38 
 
 
315 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  33.02 
 
 
315 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  33.02 
 
 
315 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.33 
 
 
315 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  32.51 
 
 
317 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.02 
 
 
315 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  33.02 
 
 
315 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
315 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.02 
 
 
315 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.02 
 
 
315 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.02 
 
 
316 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  29.81 
 
 
315 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
316 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  30.19 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
312 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
312 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
314 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
314 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  27.07 
 
 
323 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
339 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  28.26 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  28.26 
 
 
317 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  28.26 
 
 
317 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
317 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  28.26 
 
 
317 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.26 
 
 
317 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.94 
 
 
700 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  28.04 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  26.09 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  29.6 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  28.8 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  28.57 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  28.8 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  27.1 
 
 
319 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  27.1 
 
 
319 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  27.1 
 
 
319 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  27.1 
 
 
319 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  27.1 
 
 
319 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
339 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
333 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  24.18 
 
 
333 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  27.1 
 
 
315 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.6 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.6 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.6 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.6 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.6 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.6 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
335 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  26.58 
 
 
321 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  23.9 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  26.92 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
331 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  25.47 
 
 
331 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  25.47 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  24.44 
 
 
336 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  27.41 
 
 
695 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29850  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  23.82 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  26.27 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>