263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0652 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  100 
 
 
149 aa  306  9e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  61.74 
 
 
152 aa  190  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  57.43 
 
 
153 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  54.86 
 
 
148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  54.05 
 
 
157 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  57.53 
 
 
151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  57.53 
 
 
151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  57.53 
 
 
151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  52.78 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  51.72 
 
 
166 aa  167  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  53.1 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  51.05 
 
 
153 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
152 aa  153  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.33 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  53.12 
 
 
149 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  48.65 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  52.08 
 
 
152 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  47.97 
 
 
181 aa  148  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  51.77 
 
 
152 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.61 
 
 
147 aa  146  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  45.64 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  45.64 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.59 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  50 
 
 
152 aa  143  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  47.59 
 
 
322 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  45.83 
 
 
149 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  44.3 
 
 
149 aa  142  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  45.64 
 
 
149 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.22 
 
 
152 aa  140  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.3 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.89 
 
 
143 aa  138  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  43.24 
 
 
158 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  46.26 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  44.14 
 
 
152 aa  135  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.14 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.58 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.75 
 
 
153 aa  134  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
145 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  46.58 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.9 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.56 
 
 
146 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  47.18 
 
 
158 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  45.74 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  42.36 
 
 
148 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.14 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  43.06 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.54 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  43.06 
 
 
149 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  43.06 
 
 
149 aa  124  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 
370 aa  124  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  41.67 
 
 
151 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  40.69 
 
 
162 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  43.06 
 
 
149 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  45.33 
 
 
153 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  43.06 
 
 
149 aa  124  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  42.07 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  42.31 
 
 
150 aa  124  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  42.36 
 
 
149 aa  123  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.82 
 
 
142 aa  123  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.14 
 
 
142 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  45.58 
 
 
156 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40 
 
 
149 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
152 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  44 
 
 
156 aa  122  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.25 
 
 
151 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
148 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
151 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
151 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.38 
 
 
148 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 
159 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 
159 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  42.66 
 
 
159 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  42.66 
 
 
148 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  44.59 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  41.84 
 
 
144 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.97 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  44.59 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  41.78 
 
 
150 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.86 
 
 
151 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  39.86 
 
 
151 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  43.54 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  38.46 
 
 
145 aa  116  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.14 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  41.09 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.43 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  37.93 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.22 
 
 
566 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.88 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  39.31 
 
 
147 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2837  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40 
 
 
147 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  40.41 
 
 
147 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.18 
 
 
163 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
152 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  43.51 
 
 
152 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>