More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0583 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  100 
 
 
331 aa  646    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  62.31 
 
 
327 aa  412  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  60.69 
 
 
326 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  53.03 
 
 
328 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  53.03 
 
 
328 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  52.73 
 
 
328 aa  349  4e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.68 
 
 
330 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  40.72 
 
 
336 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.05 
 
 
330 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.65 
 
 
337 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.28 
 
 
315 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.41 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.41 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.41 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.3 
 
 
350 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  39.52 
 
 
348 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  36.8 
 
 
330 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  42.12 
 
 
348 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  39.22 
 
 
348 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 
343 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.71 
 
 
358 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  40.42 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.12 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.64 
 
 
362 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  38.51 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  35.57 
 
 
363 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  34.94 
 
 
354 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  35.01 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.56 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  38.39 
 
 
348 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  37.46 
 
 
337 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  34.59 
 
 
367 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.96 
 
 
330 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  34.88 
 
 
356 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  33.82 
 
 
354 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  38.41 
 
 
334 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.08 
 
 
315 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  35.96 
 
 
318 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  36.14 
 
 
334 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  36.14 
 
 
334 aa  193  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
356 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.84 
 
 
367 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  34.58 
 
 
345 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.43 
 
 
361 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  34.9 
 
 
354 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  37.16 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  33.33 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  35.02 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.97 
 
 
368 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38 
 
 
366 aa  189  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  37.46 
 
 
353 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  32.14 
 
 
338 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  35.31 
 
 
345 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.74 
 
 
367 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  34.38 
 
 
340 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.53 
 
 
452 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
342 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  37.39 
 
 
347 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  37.34 
 
 
360 aa  185  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.43 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  37.87 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  35.09 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  33.15 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  32.34 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  34.97 
 
 
338 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  31.87 
 
 
371 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
342 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  33.53 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  33.85 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.12 
 
 
359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  39.53 
 
 
376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  35.45 
 
 
340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  34.71 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.69 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  34.34 
 
 
369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  36.57 
 
 
345 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
325 aa  182  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  33.92 
 
 
372 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
342 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.44 
 
 
370 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  36 
 
 
325 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
338 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  33.13 
 
 
356 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  37.65 
 
 
323 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  34.33 
 
 
369 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  35.31 
 
 
345 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  35.31 
 
 
345 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  35.26 
 
 
338 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  33.03 
 
 
343 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  35.31 
 
 
342 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
342 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  36.43 
 
 
368 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.95 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.95 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  34.62 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.16 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  31.96 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>