More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0547 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  48.5 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  42.93 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  43.71 
 
 
196 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  36.31 
 
 
191 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  36.31 
 
 
214 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  33.15 
 
 
188 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  33.14 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  36.41 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.11 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  36.61 
 
 
189 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  35.56 
 
 
189 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.51 
 
 
191 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.52 
 
 
184 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  35.87 
 
 
189 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  34.07 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  31.72 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.39 
 
 
189 aa  92  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  30.49 
 
 
275 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.73 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  30.99 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  30.41 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
171 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
171 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.73 
 
 
170 aa  84.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  28.04 
 
 
274 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.11 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  28.83 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.82 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.92 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.47 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.65 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.81 
 
 
163 aa  79  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.19 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.12 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.78 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.32 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.95 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  31.14 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.32 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  30.32 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  26.99 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.9 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.54 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  32.04 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  27.12 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.54 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.37 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.81 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.34 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.49 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.67 
 
 
167 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.27 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.42 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  28.25 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  26.25 
 
 
274 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.57 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  25.93 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.63 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  28.49 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.08 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  21.98 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.17 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  24.84 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.74 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.07 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.4 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.49 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  24.85 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.67 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.4 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  22.65 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  27.72 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.73 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.93 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.27 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  24.72 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.12 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.11 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.06 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.37 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.53 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.19 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.27 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  27.01 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.46 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.74 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  22.7 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  26.62 
 
 
273 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.78 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  23.49 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  23.37 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  25.95 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  24.29 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  25.29 
 
 
295 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.41 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>