217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0524 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 
280 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.05 
 
 
280 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 
283 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.07 
 
 
301 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  34.46 
 
 
287 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  37.11 
 
 
283 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.06 
 
 
280 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  34.8 
 
 
313 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  36.02 
 
 
265 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 
259 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  32.21 
 
 
317 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
264 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  32.57 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 
295 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 
278 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  33.08 
 
 
284 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  34.66 
 
 
266 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  34.68 
 
 
266 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 
299 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  33.47 
 
 
284 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  31.48 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  32.83 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  31.2 
 
 
277 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
312 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
285 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
270 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  34.63 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  34.63 
 
 
263 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  34.63 
 
 
263 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
285 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 
278 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  31.41 
 
 
280 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 
281 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 
278 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  35.16 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
289 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 
276 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  30.83 
 
 
281 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  35.16 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  35.16 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  35.16 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  32.26 
 
 
294 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 
269 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 
302 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 
269 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  35.27 
 
 
269 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  34.77 
 
 
271 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 
284 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  34.77 
 
 
271 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  34.77 
 
 
271 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  30.45 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  31.44 
 
 
285 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  34.38 
 
 
271 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  29.41 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2432  XRE family transcriptional regulator  34.5 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.732467  normal  0.678442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  33.47 
 
 
281 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  32.01 
 
 
285 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 
306 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  31.46 
 
 
279 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  33.45 
 
 
284 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2768  XRE family transcriptional regulator  31.6 
 
 
318 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4526  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 
257 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  30.74 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  30 
 
 
280 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  32.13 
 
 
281 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  30.04 
 
 
292 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  30.08 
 
 
312 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  30.08 
 
 
314 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  31.92 
 
 
293 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 
297 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  31.91 
 
 
287 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 
288 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  29.82 
 
 
294 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  32.92 
 
 
282 aa  141  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  31.5 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  32.51 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  31.4 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  32.83 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  31.43 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  28.91 
 
 
293 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 
296 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 
292 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>