More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0395 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
275 aa  552  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
281 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
279 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
280 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
279 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
276 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
282 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
279 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  41.18 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
276 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
283 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  36.86 
 
 
278 aa  190  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
279 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
275 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
286 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
303 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
274 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
283 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
277 aa  185  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
280 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
285 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
280 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
281 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
286 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
274 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
294 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
283 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
276 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
284 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
299 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
288 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
279 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
293 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
293 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
293 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
283 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
278 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
273 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
287 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
291 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
287 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
291 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
291 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
292 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
276 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.25 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
258 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
284 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 
282 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
279 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
280 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
284 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
286 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
282 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
287 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  32.84 
 
 
278 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
281 aa  158  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
272 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
275 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
279 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
276 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
273 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.52 
 
 
282 aa  155  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
275 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  30.97 
 
 
275 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
295 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
290 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
272 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
284 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>