More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0302 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  100 
 
 
116 aa  224  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  84.48 
 
 
119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  69.03 
 
 
116 aa  159  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 
116 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 
116 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf247  ribosomal protein L19  65.52 
 
 
118 aa  153  7e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0015977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  66.67 
 
 
116 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 
114 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  67.57 
 
 
118 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  66.06 
 
 
115 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 
115 aa  148  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 
115 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 
115 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
115 aa  148  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  65.74 
 
 
115 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 
114 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  66.07 
 
 
114 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  67.57 
 
 
113 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 
119 aa  146  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  66.38 
 
 
119 aa  146  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  65.22 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  63.06 
 
 
118 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  64.29 
 
 
116 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 
115 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 
113 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 
114 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
127 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  61.61 
 
 
115 aa  140  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
114 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  60.71 
 
 
148 aa  140  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  59.29 
 
 
117 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  60.91 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  62.5 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  137  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
121 aa  138  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  60 
 
 
113 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 
114 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
118 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
116 aa  137  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  58.62 
 
 
118 aa  135  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  57.27 
 
 
120 aa  135  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  64.6 
 
 
124 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
115 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  59.63 
 
 
114 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  61.82 
 
 
113 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  58.72 
 
 
114 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  58.72 
 
 
114 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 
115 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  59.46 
 
 
119 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 
117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 
115 aa  134  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
118 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 
119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 
128 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  59.09 
 
 
118 aa  133  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  57.8 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  58.18 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  60.78 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0037  50S ribosomal protein L19  65.98 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0075  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  61.26 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  57.69 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  57.8 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 
117 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  66.36 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  58.65 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  57.66 
 
 
113 aa  130  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 
118 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>