More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0165 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  73.91 
 
 
93 aa  136  8.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  36.73 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  36.56 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.33 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  31.87 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  34.78 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 
95 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.91 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  34.04 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  34.78 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  34.44 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  34.74 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  31.91 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  36.96 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  33.98 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  30.85 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  26.8 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  28.72 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.99 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  30 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  32.99 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  32.61 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 
122 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  30 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  34.44 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  30.85 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>