104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0093 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 
82 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  56.96 
 
 
83 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  51.85 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  48.75 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.67 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  48.78 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  46.25 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  50.67 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  46.05 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  46.91 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.75 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  45.68 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.21 
 
 
80 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  45.12 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.67 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  47.37 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.37 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.83 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  44.44 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  42.68 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  43.42 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  40.26 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  39.02 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  39.02 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.67 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.67 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.67 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.67 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  46.67 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  40.62 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  38.75 
 
 
80 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  36.92 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  37.18 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  35.44 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  33.33 
 
 
81 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  31.65 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  32.1 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.85 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  39.39 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  38.71 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.29 
 
 
99 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 
137 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  42 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  40.82 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  40 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  40.82 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  34.67 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  32.76 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  42 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  38 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  40 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  29.63 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  40.98 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  31.75 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  42 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  35.14 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  39.34 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  38 
 
 
146 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  40 
 
 
134 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  30.38 
 
 
205 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  30.38 
 
 
205 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  30.38 
 
 
205 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  36 
 
 
134 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  34 
 
 
122 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  34.38 
 
 
128 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  26.98 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  34 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  30 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  34 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.51 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>