46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0091 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0091  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 		 306 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000878302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1715  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase transmembrane protein  38.1 
 
 		 648 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0289129  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1532  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.2 
 
 		 646 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.287828  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3780  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  32.57 
 
 		 638 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1865  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.04 
 
 		 646 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.721225  hitchhiker  0.000258425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1460  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.52 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0160  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.6 
 
 		 632 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.981021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1076  foldase protein PrsA  25.9 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.798492  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0914  major antigenic peptide PEB-cell binding factor  31.85 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.617147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0568  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.73 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000504659  normal  0.286887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3054  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.22 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0251204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5357  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.16 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.73 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.1 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0643  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.77 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2069  holo-[acyl-carrier-protein] synthase  27.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.56973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2048  tRNA pseudouridine synthase  32.12 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.970717  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4147  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.41 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000724702  decreased coverage  0.000000142354 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3109  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.53 
 
 		 619 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000348858  hitchhiker  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2806  peptidylprolyl isomerase  28.05 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4875  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.86 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  0.150667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  27.33 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0533  peptidyl-prolyl cis-trans isomerse D  28.93 
 
 		 605 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2336  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.93 
 
 		 626 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00116871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21140  peptidil-prolyl cis-trans isomerase  24.81 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.24 
 
 		 642 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3100  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.56 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0850  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.37 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0594  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.07 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1838  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.87 
 
 		 644 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213983  normal  0.0239616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.55 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1413  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.41 
 
 		 626 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000608147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1545  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.62 
 
 		 621 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000368753  hitchhiker  0.00157323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1933  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.48 
 
 		 628 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0320935  normal  0.229226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0955  SurA domain protein  33.04 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2492  peptidylprolyl isomerase  33.67 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6760  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1312  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.82 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0104824  normal  0.0149254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2939  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.08 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5221  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.8 
 
 		 644 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.406061  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_003296  RS04811  signal peptide protein  32.24 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.170909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3181  putative signal peptide protein  32.24 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.2743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1416  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.93 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.146032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1494  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.98 
 
 		 618 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000429603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3132  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.08 
 
 		 627 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000394697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>