More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0090 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0044  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.9 
 
 		 900 aa  791    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0090  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 984 aa  1960    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000165147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  38.78 
 
 		 1177 aa  619  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  42.91 
 
 		 1177 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  45.15 
 
 		 1176 aa  569  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1178 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  44.53 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  44.22 
 
 		 1176 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  43.62 
 
 		 1196 aa  559  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  44.22 
 
 		 1176 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  43.31 
 
 		 1141 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  45.13 
 
 		 1162 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  44.38 
 
 		 1176 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  34.14 
 
 		 1112 aa  559  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  43.38 
 
 		 1174 aa  559  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  45.13 
 
 		 1162 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  42.05 
 
 		 1178 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1073 aa  558  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  41.41 
 
 		 1169 aa  555  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  43.03 
 
 		 1197 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  45.68 
 
 		 1165 aa  554  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  34.71 
 
 		 1059 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  43.93 
 
 		 1170 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  43.56 
 
 		 1183 aa  555  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  43.53 
 
 		 1162 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  42.04 
 
 		 1123 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  32.79 
 
 		 1103 aa  546  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  42.9 
 
 		 1165 aa  548  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  45.91 
 
 		 1168 aa  548  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  37.04 
 
 		 1120 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  41.98 
 
 		 1155 aa  541  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  42.43 
 
 		 1197 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  39.75 
 
 		 1168 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  44.98 
 
 		 1179 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  39.75 
 
 		 1168 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1116 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1109 aa  538  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  36.39 
 
 		 1126 aa  533  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  34.79 
 
 		 1099 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  39.74 
 
 		 1169 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  45.09 
 
 		 1244 aa  536  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  36 
 
 		 1107 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  36.46 
 
 		 1103 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  45.43 
 
 		 1165 aa  527  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  37.27 
 
 		 1127 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  34.96 
 
 		 1126 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  39.41 
 
 		 1183 aa  525  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  37.7 
 
 		 1207 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  42.18 
 
 		 1176 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  40.81 
 
 		 1150 aa  522  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  45.81 
 
 		 1170 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  42.11 
 
 		 1159 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.56 
 
 		 974 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  39.61 
 
 		 1234 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.13 
 
 		 893 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  34.87 
 
 		 1115 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  39.82 
 
 		 1179 aa  511  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  39.17 
 
 		 1148 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  42.38 
 
 		 1188 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  39.05 
 
 		 1154 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  40.52 
 
 		 1202 aa  508  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  41.29 
 
 		 1158 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  38.32 
 
 		 1211 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1157 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  41.3 
 
 		 1165 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  41.29 
 
 		 1158 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  39.28 
 
 		 1211 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  39.8 
 
 		 1189 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  38.32 
 
 		 1211 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  38.66 
 
 		 1164 aa  505  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1157 aa  506  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  37.32 
 
 		 1182 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  38.53 
 
 		 1194 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  43.83 
 
 		 1158 aa  506  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2006  transcription-repair coupling factor  40.92 
 
 		 1155 aa  505  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000316908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  40.87 
 
 		 1168 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  42.74 
 
 		 1198 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.17 
 
 		 1246 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  39.27 
 
 		 1265 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2504  transcription-repair coupling factor  37.9 
 
 		 1167 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0917157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3157  transcription-repair coupling factor  39.43 
 
 		 1164 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2578  transcription-repair coupling factor  37.85 
 
 		 1165 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  40.41 
 
 		 1149 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  40.37 
 
 		 1148 aa  497  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1157 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  39.82 
 
 		 1149 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1207 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  39.82 
 
 		 1149 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1169 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  36.35 
 
 		 893 aa  498  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  39.75 
 
 		 1188 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  39.7 
 
 		 1182 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1179 aa  499  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  39.82 
 
 		 1141 aa  499  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  38.61 
 
 		 1212 aa  499  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>