More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0077 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  73.56 
 
 		 185 aa  265  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 184 aa  204  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 184 aa  204  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  201  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  51.67 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  50 
 
 		 182 aa  192  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 181 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2593  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.471073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  183  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  47.49 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.6 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3193  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  46.37 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>