17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0074 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0074    100 
 
 
771 bp  1528    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1798    93.75 
 
 
261 bp  71.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000731814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0761  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
510 bp  71.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3150    89.8 
 
 
1178 bp  58  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0761    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000972651  hitchhiker  0.00399976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0800    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016388  hitchhiker  0.00261748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1527    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000738953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1529    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000634388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1591    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000513635  unclonable  2.5279900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1977    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1986    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.068548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2130    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0670174  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2524    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2555    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2829    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0759    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000277233  hitchhiker  0.00128457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0715    96.67 
 
 
864 bp  52  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>