More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0006 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0006  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000077593  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  57.21 
 
 		 642 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  42.22 
 
 		 660 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  44.16 
 
 		 640 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  40.89 
 
 		 627 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  41.78 
 
 		 637 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  42.86 
 
 		 640 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  39.22 
 
 		 651 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  41.38 
 
 		 825 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  41.42 
 
 		 652 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  38.5 
 
 		 797 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0004  DNA gyrase, B subunit  38.53 
 
 		 801 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0231697  decreased coverage  0.000608059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0003  DNA gyrase, B subunit  38.53 
 
 		 800 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  39.38 
 
 		 798 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  41.85 
 
 		 642 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  43.04 
 
 		 640 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  43.04 
 
 		 640 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  40.35 
 
 		 636 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  37.78 
 
 		 650 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  39.74 
 
 		 659 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  40.79 
 
 		 636 aa  168  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  40.99 
 
 		 634 aa  167  9e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  38.5 
 
 		 640 aa  167  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  39.74 
 
 		 650 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  39.04 
 
 		 644 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  38.17 
 
 		 644 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  39.82 
 
 		 640 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  39.91 
 
 		 633 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  40 
 
 		 658 aa  165  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  43.56 
 
 		 638 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  39.46 
 
 		 635 aa  165  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  43.11 
 
 		 638 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2083  DNA gyrase, B subunit  38.16 
 
 		 798 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  41.85 
 
 		 640 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  38.43 
 
 		 802 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  41.15 
 
 		 641 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  35.06 
 
 		 628 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  41.41 
 
 		 640 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  40.97 
 
 		 640 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  41.41 
 
 		 640 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  38.7 
 
 		 632 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  41.85 
 
 		 640 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  40.17 
 
 		 645 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  38.7 
 
 		 654 aa  161  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  38.2 
 
 		 645 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  40.53 
 
 		 640 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  40.53 
 
 		 640 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  40.53 
 
 		 640 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0004  DNA gyrase, B subunit  39.3 
 
 		 810 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  40.53 
 
 		 640 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  40.53 
 
 		 640 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  40.53 
 
 		 640 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  40.44 
 
 		 633 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  41.05 
 
 		 633 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  36.56 
 
 		 641 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  38.5 
 
 		 644 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  34.4 
 
 		 656 aa  157  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  36.28 
 
 		 635 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2472  DNA gyrase, B subunit  34.96 
 
 		 794 aa  158  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000184576  decreased coverage  0.00000743586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  36.61 
 
 		 644 aa  157  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  38.96 
 
 		 651 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  37.13 
 
 		 655 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0005  DNA gyrase, B subunit  37.78 
 
 		 801 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  38.05 
 
 		 634 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  35.74 
 
 		 655 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  38.77 
 
 		 641 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  38.5 
 
 		 638 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  40.71 
 
 		 638 aa  155  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  37.39 
 
 		 645 aa  155  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  36.73 
 
 		 796 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  41.05 
 
 		 643 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3095  DNA gyrase, B subunit  37.12 
 
 		 803 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0405  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  38.33 
 
 		 805 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  38.26 
 
 		 652 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  35.37 
 
 		 637 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  37.55 
 
 		 655 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  36.28 
 
 		 796 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  40.98 
 
 		 666 aa  154  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  37.28 
 
 		 636 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  37.12 
 
 		 642 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  40 
 
 		 675 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  38.79 
 
 		 661 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  40.49 
 
 		 675 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0004  DNA gyrase, B subunit  35.65 
 
 		 807 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  34.82 
 
 		 644 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  38.77 
 
 		 672 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  38.54 
 
 		 808 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  40.49 
 
 		 675 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  40.49 
 
 		 675 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  37.61 
 
 		 795 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0004  DNA gyrase, B subunit  40.47 
 
 		 795 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  40.49 
 
 		 675 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  37.28 
 
 		 651 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  40.47 
 
 		 795 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0004  DNA gyrase, B subunit  40.47 
 
 		 795 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  37.44 
 
 		 807 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0004  DNA gyrase, B subunit  37.93 
 
 		 817 aa  152  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127407  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  33.61 
 
 		 655 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  37.61 
 
 		 795 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  35.4 
 
 		 649 aa  151  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>