18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0004 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
286 aa  564  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  26.37 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  30.48 
 
 
162 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  28.7 
 
 
155 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  27.62 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  25.71 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  23.75 
 
 
188 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  29.23 
 
 
179 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  27.05 
 
 
151 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  26.44 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  26.44 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  26.44 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  24.76 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  24.11 
 
 
159 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  22.92 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  19.3 
 
 
168 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>