More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2863 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
423 aa  821  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  59.81 
 
 
427 aa  486  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  33.18 
 
 
446 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  32.72 
 
 
463 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  31.56 
 
 
476 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  30.73 
 
 
471 aa  180  5e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  29.58 
 
 
469 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  28.57 
 
 
459 aa  174  2e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  29.63 
 
 
445 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  29 
 
 
457 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
443 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  28.54 
 
 
443 aa  166  7e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  28.54 
 
 
443 aa  166  7e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
443 aa  166  7e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
443 aa  166  7e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  28.54 
 
 
443 aa  166  7e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  29.66 
 
 
452 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
443 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  29.56 
 
 
464 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  28.31 
 
 
443 aa  163  4e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  28.77 
 
 
438 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
477 aa  162  8e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.07 
 
 
455 aa  162  8e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
451 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  29 
 
 
458 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  30.75 
 
 
443 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  30.75 
 
 
441 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.29 
 
 
455 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  29.27 
 
 
467 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.41 
 
 
459 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.64 
 
 
463 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  29.1 
 
 
468 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  29.1 
 
 
468 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  29.1 
 
 
468 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  29.1 
 
 
468 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  29.1 
 
 
468 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
451 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
474 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  28.06 
 
 
499 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
460 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.17 
 
 
473 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.05 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.4 
 
 
474 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.05 
 
 
474 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  28.57 
 
 
443 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.69 
 
 
476 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.72 
 
 
471 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.63 
 
 
460 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.05 
 
 
480 aa  149  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.56 
 
 
477 aa  149  1e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  27.03 
 
 
454 aa  148  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  28.93 
 
 
457 aa  148  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
472 aa  148  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  30.33 
 
 
442 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.86 
 
 
472 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  30.09 
 
 
442 aa  146  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.35 
 
 
457 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.27 
 
 
447 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.87137e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.16 
 
 
474 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  29.23 
 
 
465 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.22 
 
 
473 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
465 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  26.85 
 
 
465 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  29.12 
 
 
468 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.43 
 
 
478 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.43 
 
 
478 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
398 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
478 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
478 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
478 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
461 aa  142  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
478 aa  141  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  30 
 
 
436 aa  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  25.95 
 
 
452 aa  140  4e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.92 
 
 
478 aa  140  4e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  30 
 
 
436 aa  140  4e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.5 
 
 
399 aa  140  4e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.05464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
451 aa  140  5e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
399 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.23204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.25 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.59613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.80591e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.22558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
399 aa  139  9e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.69498e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  26.95 
 
 
480 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  26.95 
 
 
480 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.57 
 
 
399 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.14177e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  29.38 
 
 
452 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  29.38 
 
 
452 aa  137  3e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  29.38 
 
 
452 aa  137  3e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.5 
 
 
399 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  28.33 
 
 
442 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.5 
 
 
399 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.25853e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  29.72 
 
 
460 aa  136  6e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
404 aa  136  6e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
508 aa  136  6e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.63 
 
 
459 aa  135  1e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  26.79 
 
 
480 aa  134  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30.34 
 
 
526 aa  135  2e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>