43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2549 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2549  SMC domain protein  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0441079  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  28.37 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  22.79 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  23.5 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  20.91 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  21.18 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  20.91 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  31.31 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  22.16 
 
 		 593 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  30.3 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  30.3 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  26.02 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  25.15 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  22.19 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  22.87 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  20.44 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  32.06 
 
 		 140 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  24.26 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  28.81 
 
 		 428 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  31.4 
 
 		 394 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  21.5 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  35.29 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  29.11 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  44 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  32.2 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0005  DNA replication and repair protein RecF  48.89 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.478589  hitchhiker  0.000458598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  32.93 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  29.11 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  32.94 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3380  ABC transporter related  28.83 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679139  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  29.51 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.85 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  29.51 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  20.81 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  21.62 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  26.21 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  21.62 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  28.76 
 
 		 421 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2936  ABC transporter related  29.37 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  50 
 
 		 391 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  26.11 
 
 		 393 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  24.04 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  51.16 
 
 		 396 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>