More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2507 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.63 
 
 
293 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.25 
 
 
299 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.25 
 
 
300 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.14 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.35 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1426  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.16 
 
 
288 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.41063  hitchhiker  0.00349813 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.86 
 
 
276 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.23 
 
 
285 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.68 
 
 
298 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.06 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0477  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.7 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.0000000000065602  decreased coverage  0.00000000361225 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.66 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.21 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.57 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1537  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.09 
 
 
275 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.25 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.12 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.43 
 
 
294 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.39 
 
 
296 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.24 
 
 
297 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1403  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.14 
 
 
288 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.87 
 
 
284 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.158917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2028  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.22 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.2 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.27 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.97 
 
 
296 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4446  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.31 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2097  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.36 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.74 
 
 
278 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.38 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0627  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.48 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.144272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.88 
 
 
298 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.96 
 
 
327 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.18 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.27 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.75 
 
 
280 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.62 
 
 
261 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.89 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  33.1 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0187  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.58 
 
 
270 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0254  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.58 
 
 
283 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.56 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2753  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.48 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94002  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0776  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.74 
 
 
295 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.42 
 
 
295 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.58 
 
 
294 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.58 
 
 
294 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0753  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.09 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0925  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.75 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3490  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.9 
 
 
296 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1684  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.77 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.09 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.29 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.289187  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0735  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.850791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.58 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.89 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3934  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.98 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.17 
 
 
301 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000309254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.19 
 
 
286 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.14 
 
 
293 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  32.98 
 
 
294 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.43 
 
 
461 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.00000000841547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1285  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.73 
 
 
301 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.12 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1054  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.83 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3287  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.3 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.41 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1080  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.41 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1396  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.32 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.08 
 
 
304 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0714  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.04 
 
 
300 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.77 
 
 
298 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4296  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.49 
 
 
298 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.73519  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.88 
 
 
296 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.66 
 
 
304 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.25 
 
 
294 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30 
 
 
304 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.21 
 
 
296 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2405  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.92 
 
 
284 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.21 
 
 
296 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.62 
 
 
286 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.6 
 
 
303 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.33 
 
 
284 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.25 
 
 
283 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.73 
 
 
285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3345  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.11 
 
 
278 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.26 
 
 
306 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.94 
 
 
307 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.15 
 
 
321 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.15 
 
 
321 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.67 
 
 
291 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.91 
 
 
284 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15930  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.17 
 
 
299 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3020  dTDP-6-deoxy-l-mannose-dehydrogenase  31.91 
 
 
293 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.66 
 
 
289 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.29 
 
 
304 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1444  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  31.84 
 
 
283 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>