26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2379 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2379  ATPase  100 
 
 
356 aa  713    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  45.81 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  36.64 
 
 
359 aa  226  6e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  36.19 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  36.16 
 
 
356 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1319  ATPase  39.38 
 
 
312 aa  203  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  34.62 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  36.36 
 
 
383 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  32.88 
 
 
377 aa  189  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  35.81 
 
 
365 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  31.59 
 
 
342 aa  162  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  30.98 
 
 
350 aa  159  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2746  ATPase  30.06 
 
 
387 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0705142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2867  ATPase  26.25 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  26.67 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  23.18 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  24.14 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  25.93 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  24.78 
 
 
456 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  26.98 
 
 
456 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  26.05 
 
 
456 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  27.38 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  26.81 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  24.21 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  25.4 
 
 
462 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  23.65 
 
 
463 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>