35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2310 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  45.45 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  40.51 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  40.91 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  40.51 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  39.77 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  35.48 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  32.91 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  32.95 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 
131 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  28.41 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  34.72 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  30.68 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 
131 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  25.61 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  27.38 
 
 
147 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  27.59 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  28 
 
 
135 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>