More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2143 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  100 
 
 
356 aa  722    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  48.17 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  32.97 
 
 
374 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  33.33 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  31.21 
 
 
374 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.17 
 
 
377 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 
372 aa  183  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  30 
 
 
373 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  31.64 
 
 
376 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  31.87 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  29.85 
 
 
409 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  29.35 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  31.99 
 
 
363 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  28.65 
 
 
372 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  31.45 
 
 
374 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
382 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  30.03 
 
 
404 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  26.2 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 
399 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  27.35 
 
 
380 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  27.76 
 
 
382 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  29.39 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  32.92 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0749  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 
401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000245467  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  28.36 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  26.32 
 
 
370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  28.32 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  29.65 
 
 
392 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  29.65 
 
 
392 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  28.36 
 
 
367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  30.42 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  26.9 
 
 
383 aa  126  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.25 
 
 
377 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.25 
 
 
377 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  28.48 
 
 
396 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  26.68 
 
 
380 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  25.49 
 
 
362 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 
423 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  30.5 
 
 
409 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
373 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  28.66 
 
 
394 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 
394 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  27.74 
 
 
377 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  27.73 
 
 
397 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  28.07 
 
 
397 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  28 
 
 
397 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  29.59 
 
 
393 aa  123  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  29.36 
 
 
407 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 
388 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  28.48 
 
 
391 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  27.93 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2619  aminotransferase class I and II  26.52 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.97 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  26.61 
 
 
379 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  26.07 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  30.04 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  27.99 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  26.43 
 
 
385 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.86 
 
 
397 aa  119  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  27.07 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0990  aminotransferase  26.88 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0114573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  27.07 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0895  aminotransferase  26.98 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.515472  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  25.3 
 
 
405 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  25.77 
 
 
380 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.51 
 
 
398 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  29.96 
 
 
397 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  26.38 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  29.14 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  26.1 
 
 
399 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  26.21 
 
 
387 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  25.62 
 
 
396 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  27.51 
 
 
385 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  25.53 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  26.47 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  28.44 
 
 
399 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  26.69 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  26.33 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  26.04 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  26.65 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.44 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.52 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  30.6 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  26.17 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.61 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  27.02 
 
 
386 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  25.62 
 
 
404 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  24.02 
 
 
398 aa  113  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  25.08 
 
 
385 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  27.06 
 
 
398 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  30.13 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  31.05 
 
 
375 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>