60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2138 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
902 aa  1800    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
1187 aa  151  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 
609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 
606 aa  122  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 
1162 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  27.93 
 
 
1042 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
994 aa  102  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  30.54 
 
 
1000 aa  102  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 
732 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 
734 aa  97.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 
1006 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  24.17 
 
 
829 aa  92.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  24.53 
 
 
729 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 
731 aa  92  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  23.67 
 
 
674 aa  91.7  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  25.6 
 
 
728 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
1022 aa  87.4  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  23.43 
 
 
729 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  24.7 
 
 
728 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
744 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
726 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  25.27 
 
 
749 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  25.27 
 
 
749 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  24.77 
 
 
695 aa  74.3  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
551 aa  73.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  22.29 
 
 
726 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  24.78 
 
 
744 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  22.86 
 
 
726 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  24.18 
 
 
580 aa  70.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 
582 aa  67.4  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  24.42 
 
 
747 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
566 aa  64.7  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  22.52 
 
 
568 aa  62.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  22.52 
 
 
568 aa  62.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  24.46 
 
 
577 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 
722 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  26.09 
 
 
743 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  22.38 
 
 
759 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
485 aa  58.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  28.88 
 
 
407 aa  57  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  25.15 
 
 
574 aa  57.4  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  24.16 
 
 
566 aa  57  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
580 aa  55.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
471 aa  55.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 
485 aa  55.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  20.5 
 
 
570 aa  54.3  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
575 aa  54.3  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 
472 aa  52.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
813 aa  48.9  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 
817 aa  47.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  21.54 
 
 
584 aa  47  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  25.27 
 
 
518 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  26.15 
 
 
812 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
521 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 
823 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
521 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
521 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 
394 aa  45.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 
811 aa  44.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  21.83 
 
 
794 aa  44.3  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>