More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2134 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  100 
 
 
368 aa  736    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  45.01 
 
 
370 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  44.09 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  44.09 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  42.97 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  46.81 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  43.68 
 
 
374 aa  305  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  45.63 
 
 
359 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  41.71 
 
 
370 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  44.27 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  44.29 
 
 
363 aa  301  1e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  43.48 
 
 
367 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  42.47 
 
 
367 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
366 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  42.47 
 
 
367 aa  299  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  41.35 
 
 
366 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
366 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
366 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 
366 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.66 
 
 
363 aa  296  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  45.36 
 
 
353 aa  296  5e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  41.03 
 
 
367 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
357 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  41.74 
 
 
352 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  41.74 
 
 
349 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
360 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 
360 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  44.94 
 
 
365 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  41 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  41 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  41 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
380 aa  289  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  40.33 
 
 
363 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
352 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
364 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  41.71 
 
 
357 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  42.16 
 
 
366 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
370 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
369 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  40.96 
 
 
374 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  41.32 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  44.62 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  42.36 
 
 
384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
360 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.74 
 
 
355 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.46 
 
 
355 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  43.21 
 
 
381 aa  285  9e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  41.44 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.95 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.05 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  40.64 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1481  ABC transporter related  43.23 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00851578  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  41.92 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  42.86 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  44.57 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  43.41 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  42.9 
 
 
364 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  42.05 
 
 
370 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 
378 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  41.78 
 
 
361 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.85 
 
 
359 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
381 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  42.7 
 
 
372 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  41.35 
 
 
362 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  41.11 
 
 
386 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  44.67 
 
 
368 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
363 aa  279  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 
357 aa  279  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  40.71 
 
 
355 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  41.34 
 
 
365 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  39.57 
 
 
370 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  39.67 
 
 
365 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  41.18 
 
 
370 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.83 
 
 
349 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
381 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.1 
 
 
386 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  40.77 
 
 
355 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 
349 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  44.07 
 
 
380 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  40.86 
 
 
372 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  40.22 
 
 
340 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  41.81 
 
 
352 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  41.83 
 
 
356 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  44.22 
 
 
363 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  39.57 
 
 
368 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
372 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.86 
 
 
379 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41 
 
 
357 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.58 
 
 
361 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  43.17 
 
 
362 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  40.22 
 
 
335 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  41.32 
 
 
366 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>