177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1968 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
622 aa  1271    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  58.67 
 
 
615 aa  767    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  35.7 
 
 
650 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  33.33 
 
 
668 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  34.91 
 
 
647 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  32.55 
 
 
663 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  34.16 
 
 
670 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  33.18 
 
 
645 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  32.78 
 
 
649 aa  306  6e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  32.23 
 
 
615 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.42 
 
 
569 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.53 
 
 
644 aa  227  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.64 
 
 
644 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  30.27 
 
 
604 aa  194  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  27.47 
 
 
647 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  27.4 
 
 
621 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  26.95 
 
 
621 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  25.87 
 
 
673 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  27.4 
 
 
621 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  27.2 
 
 
621 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.92 
 
 
627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  28.48 
 
 
611 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  25.23 
 
 
642 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  27.03 
 
 
363 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  24.01 
 
 
602 aa  101  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  24.25 
 
 
565 aa  97.8  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  22.77 
 
 
610 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  24.7 
 
 
583 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  24.06 
 
 
622 aa  94  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  25.81 
 
 
584 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  24.81 
 
 
578 aa  88.2  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  22.54 
 
 
595 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4631  glycoside hydrolase 15-related  21.83 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0489  hypothetical protein  24.87 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0465  hypothetical protein  24.37 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0734  glucoamylase and related glycosyl hydrolases  21.83 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.7 
 
 
761 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.77 
 
 
801 aa  67.4  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  22.41 
 
 
596 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  20.34 
 
 
636 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  22.89 
 
 
847 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  21.59 
 
 
842 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  23.76 
 
 
611 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  21.74 
 
 
844 aa  64.3  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  24.2 
 
 
632 aa  63.9  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  22.82 
 
 
599 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  21.08 
 
 
786 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  22.49 
 
 
589 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  22.86 
 
 
867 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  22.02 
 
 
592 aa  62  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  22.92 
 
 
867 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  19.81 
 
 
598 aa  60.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.38 
 
 
715 aa  60.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  25.7 
 
 
636 aa  60.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  22.02 
 
 
592 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  19.42 
 
 
601 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  21.12 
 
 
672 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  21.13 
 
 
636 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  22.98 
 
 
867 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  22.44 
 
 
645 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  21.72 
 
 
645 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1640  glycoside hydrolase 15-related  23.15 
 
 
887 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  22.6 
 
 
639 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  23.84 
 
 
629 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.47 
 
 
692 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.47 
 
 
681 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  23.81 
 
 
893 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  21.8 
 
 
598 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  21.23 
 
 
639 aa  58.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  21.33 
 
 
642 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  21.94 
 
 
677 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  21.94 
 
 
677 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  21.7 
 
 
635 aa  57  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  22.14 
 
 
601 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  20.98 
 
 
870 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  20.31 
 
 
868 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  22.25 
 
 
605 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  23.04 
 
 
597 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  20.78 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  21.94 
 
 
677 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  22.45 
 
 
472 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  26.11 
 
 
549 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  20.8 
 
 
626 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  21.71 
 
 
696 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  21.53 
 
 
611 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  26.34 
 
 
683 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  20.74 
 
 
609 aa  55.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  22.1 
 
 
605 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  21.6 
 
 
876 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  21.8 
 
 
609 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  20.58 
 
 
598 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4516  glycoside hydrolase 15-related  23.64 
 
 
669 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  21.93 
 
 
869 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  20.82 
 
 
662 aa  53.9  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 
605 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 
610 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  21.53 
 
 
611 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  21.43 
 
 
610 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  21.43 
 
 
610 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  21.59 
 
 
659 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>