More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1950 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  100 
 
 
447 aa  898    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  72.23 
 
 
446 aa  660    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  46.65 
 
 
449 aa  389  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.6 
 
 
431 aa  389  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  48.26 
 
 
450 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  46.51 
 
 
433 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  45.76 
 
 
450 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  45.31 
 
 
450 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  45.19 
 
 
450 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  44.84 
 
 
431 aa  370  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  45.3 
 
 
433 aa  368  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  44.58 
 
 
433 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  45.76 
 
 
450 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  43.62 
 
 
444 aa  348  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  41.83 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.04 
 
 
449 aa  342  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  43.86 
 
 
446 aa  341  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  41.23 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  43.43 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  42.56 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  41.47 
 
 
443 aa  331  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  41.2 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  43.75 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.55 
 
 
469 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.95 
 
 
464 aa  315  7e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.62 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.44 
 
 
464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  42.08 
 
 
433 aa  307  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  41.86 
 
 
433 aa  306  6e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  39.41 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  39.64 
 
 
510 aa  302  8.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  40.88 
 
 
561 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  39.43 
 
 
453 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  39.09 
 
 
439 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  39.72 
 
 
445 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  38.69 
 
 
479 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  36.91 
 
 
441 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.38 
 
 
446 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  38.39 
 
 
513 aa  286  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  40.2 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  39.19 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  40.28 
 
 
542 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  38.41 
 
 
449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  39.61 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  37.41 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  39.46 
 
 
469 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  38.79 
 
 
453 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.28 
 
 
443 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  38.33 
 
 
446 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  38.61 
 
 
450 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.04 
 
 
447 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  37.64 
 
 
440 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.01 
 
 
443 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  39 
 
 
443 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  36.32 
 
 
449 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  37.12 
 
 
442 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.1 
 
 
447 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  39.51 
 
 
476 aa  276  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.6 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.19 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.69 
 
 
470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  36.73 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  36.38 
 
 
515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  39.02 
 
 
449 aa  274  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  36.32 
 
 
453 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.55 
 
 
449 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.16 
 
 
511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  38.26 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.02 
 
 
490 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.75 
 
 
443 aa  272  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  37.44 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  38.94 
 
 
446 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  37.2 
 
 
449 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  37.2 
 
 
449 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  37.2 
 
 
449 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  37.2 
 
 
449 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  37.2 
 
 
449 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  36.96 
 
 
446 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  35.24 
 
 
515 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  38.8 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  37.41 
 
 
451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  36.96 
 
 
449 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  36.96 
 
 
449 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  36.55 
 
 
452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1301  signal recognition particle protein  37.78 
 
 
514 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.556432  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  34.87 
 
 
442 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.17 
 
 
447 aa  269  7e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  36.96 
 
 
449 aa  269  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  37.15 
 
 
492 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  36.96 
 
 
449 aa  269  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  37.2 
 
 
449 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  38.2 
 
 
449 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  37.44 
 
 
452 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  36.92 
 
 
492 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5930  signal recognition particle protein  36.99 
 
 
518 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
488 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  36.71 
 
 
455 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1190  signal recognition particle protein  38.02 
 
 
514 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260849  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.76 
 
 
478 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.07 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>