9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1891 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1891  conserved hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.522365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1671  hypothetical protein  53.33 
 
 
270 aa  266  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000972701  normal  0.698741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1430  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
223 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1695  Snf7  38.1 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2179  hypothetical protein  34.62 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54958  hitchhiker  0.000254205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1866  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 
221 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0061  hypothetical protein  26.54 
 
 
216 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0816  SNF7 protein  33.13 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.283391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0029  hypothetical protein  24.69 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>