More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1889 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 668 aa  1347    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  37.65 
 
 		 817 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  34.41 
 
 		 814 aa  321  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  34.47 
 
 		 812 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  33.82 
 
 		 814 aa  317  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  34.33 
 
 		 853 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 702 aa  278  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.62 
 
 		 837 aa  259  9e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 747 aa  258  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  30.93 
 
 		 942 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.24 
 
 		 938 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  30.03 
 
 		 931 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  32.08 
 
 		 743 aa  249  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  30.02 
 
 		 931 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 744 aa  243  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  30.78 
 
 		 834 aa  242  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  29.97 
 
 		 771 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.12 
 
 		 849 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  27.63 
 
 		 844 aa  221  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 863 aa  219  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  28.33 
 
 		 837 aa  215  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  28.14 
 
 		 827 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  27.3 
 
 		 935 aa  209  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  27.43 
 
 		 843 aa  206  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.26 
 
 		 864 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  27.56 
 
 		 610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  27.04 
 
 		 604 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  26.66 
 
 		 604 aa  189  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  26.87 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  26.45 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  26.67 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  25.97 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 691 aa  171  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  30.23 
 
 		 689 aa  169  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  28.48 
 
 		 896 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  28.69 
 
 		 876 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  27.41 
 
 		 715 aa  168  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  27.12 
 
 		 780 aa  166  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  27.75 
 
 		 859 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  28.53 
 
 		 876 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  27.24 
 
 		 721 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 700 aa  165  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.3 
 
 		 700 aa  165  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 697 aa  165  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 700 aa  165  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  27.88 
 
 		 697 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  28.22 
 
 		 762 aa  164  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  28.27 
 
 		 891 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  27.77 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  29.34 
 
 		 695 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 710 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 693 aa  161  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  27.56 
 
 		 920 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  26.06 
 
 		 719 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  27.07 
 
 		 616 aa  160  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  27.02 
 
 		 865 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  26.34 
 
 		 768 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 696 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  26.1 
 
 		 879 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  28.3 
 
 		 877 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  27.16 
 
 		 711 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  27.45 
 
 		 865 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  26.69 
 
 		 865 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.94 
 
 		 608 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  25.89 
 
 		 712 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  28.33 
 
 		 839 aa  157  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  27.98 
 
 		 702 aa  157  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  26.71 
 
 		 839 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  26.73 
 
 		 804 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  26 
 
 		 854 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  27.48 
 
 		 693 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  27.45 
 
 		 865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  28.64 
 
 		 681 aa  155  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  26.95 
 
 		 975 aa  155  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  27.45 
 
 		 865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  27.45 
 
 		 865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  26.89 
 
 		 865 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.25 
 
 		 696 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  27.26 
 
 		 889 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  26.71 
 
 		 876 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.36 
 
 		 695 aa  154  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  26.19 
 
 		 788 aa  153  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  27.32 
 
 		 858 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  26.65 
 
 		 908 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  27.89 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  25.08 
 
 		 980 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  27.1 
 
 		 910 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  28.6 
 
 		 704 aa  152  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 743 aa  152  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  26.12 
 
 		 846 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  27.3 
 
 		 888 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  28.38 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  26.3 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 697 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  26.41 
 
 		 703 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  27.93 
 
 		 708 aa  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  26.82 
 
 		 981 aa  151  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  26.21 
 
 		 1002 aa  151  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  27.69 
 
 		 711 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  26.47 
 
 		 982 aa  151  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>