More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1878 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 816 aa  1665    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  70.63 
 
 		 808 aa  1208    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 809 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 869 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 865 aa  562  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 886 aa  556  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 906 aa  554  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 886 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 886 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 886 aa  548  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 858 aa  536  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 855 aa  537  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 863 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 865 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 864 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 908 aa  507  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 905 aa  504  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 896 aa  504  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 863 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 865 aa  502  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 892 aa  495  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 928 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 799 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 799 aa  440  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 802 aa  438  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 806 aa  437  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 799 aa  433  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 808 aa  432  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 882 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 881 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 881 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 771 aa  410  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 881 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 883 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 880 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 879 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 855 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 880 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 880 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 879 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 865 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 865 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 884 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 881 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 883 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 881 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 867 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 882 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 866 aa  389  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 885 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 874 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 886 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 881 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  30.89 
 
 		 836 aa  379  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 879 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 892 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 880 aa  374  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  29.52 
 
 		 861 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 892 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 		 880 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 880 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  30.39 
 
 		 846 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 876 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 885 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  29.87 
 
 		 925 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 876 aa  364  4e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 883 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 891 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 879 aa  363  8e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 911 aa  361  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 871 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 		 894 aa  360  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 845 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0620  valyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 895 aa  360  7e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.259401  normal  0.18712 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 906 aa  359  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  30.06 
 
 		 858 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  29.83 
 
 		 916 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 883 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 888 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  28.62 
 
 		 886 aa  357  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 873 aa  356  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 909 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 872 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 883 aa  354  4e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 888 aa  354  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 880 aa  354  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 909 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 860 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 881 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 881 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 881 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 881 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 881 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 877 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 880 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 879 aa  352  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 881 aa  351  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 876 aa  351  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 876 aa  351  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>