17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1840 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  729    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  34.29 
 
 
328 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  27.7 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  23.25 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  27.59 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  25.62 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  28.44 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  25.95 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  26.62 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  24.63 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  23.38 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  24.81 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  25.19 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  22.78 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  25.69 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  25.69 
 
 
290 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  24.47 
 
 
276 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>