74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1814 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 
76 aa  152  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  87.84 
 
 
75 aa  134  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  61.43 
 
 
78 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  59.72 
 
 
73 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  50 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  54.29 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  54.29 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  54.29 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  50.68 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.32 
 
 
75 aa  73.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  47.22 
 
 
72 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  58.46 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  53.85 
 
 
80 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  47.22 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  44.3 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.32 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  57.14 
 
 
76 aa  67  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  47.95 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  50 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  43.66 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.25 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  42.03 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  41.1 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  37.84 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  43.66 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  36.62 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  36.49 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  47.62 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  44.44 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.85 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.22559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  37.14 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  41.67 
 
 
93 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  47.76 
 
 
74 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.56 
 
 
287 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  37.84 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.62 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  44.44 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.32 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.66 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.43 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  45.83 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  42.86 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  42.86 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.86 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  42.37 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  38 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  43.55 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  40.68 
 
 
65 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.64 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  42.11 
 
 
74 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  37.33 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  36.21 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  38.46 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.28 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.29 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  37.31 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  33.8 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  36.36 
 
 
225 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.92 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  33.33 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  43.48 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02920  small nuclear ribonucleoprotein E, putative  29.21 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0578232  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  32.14 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.65 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  37.93 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  42.59 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  38.89 
 
 
87 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  37.5 
 
 
97 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.62 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  35.06 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  40.74 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  38.18 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  29.67 
 
 
166 aa  40  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>