More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1801 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
403 aa  796    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  55.5 
 
 
404 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  46.19 
 
 
411 aa  332  6e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  47.95 
 
 
400 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  42.39 
 
 
402 aa  322  7e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  43.07 
 
 
402 aa  320  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  45.57 
 
 
411 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  45.06 
 
 
411 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.06 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  44.11 
 
 
414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  44.64 
 
 
411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  43.97 
 
 
400 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  44.47 
 
 
400 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  40.7 
 
 
399 aa  289  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  39.9 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  39.7 
 
 
400 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  38.07 
 
 
393 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  37.88 
 
 
393 aa  269  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  37.53 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  38.32 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  38.17 
 
 
439 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  40.2 
 
 
399 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  39.16 
 
 
403 aa  256  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  37.53 
 
 
401 aa  249  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  39.59 
 
 
393 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  35.73 
 
 
405 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.47 
 
 
405 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.98 
 
 
349 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.08 
 
 
393 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.55 
 
 
356 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.19 
 
 
355 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.54 
 
 
357 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.94 
 
 
354 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.11 
 
 
376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.44 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.67 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.02 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.54 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.42 
 
 
344 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.14 
 
 
355 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
383 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.42 
 
 
358 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.49 
 
 
354 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.42 
 
 
384 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.82 
 
 
357 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
397 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.72 
 
 
355 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.98 
 
 
359 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.81 
 
 
357 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.81 
 
 
357 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.48 
 
 
357 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.63 
 
 
357 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
384 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.21 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.93 
 
 
355 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.21 
 
 
355 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.49 
 
 
355 aa  153  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.55 
 
 
354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.95 
 
 
784 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  34.95 
 
 
784 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  34.95 
 
 
784 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  34.92 
 
 
784 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  35.76 
 
 
784 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  35.76 
 
 
784 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
388 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  34.95 
 
 
784 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.65 
 
 
784 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.64 
 
 
356 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
351 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.53 
 
 
357 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  34.65 
 
 
358 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.64 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.02 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.81 
 
 
784 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.81 
 
 
784 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
785 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.02 
 
 
364 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.13 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0047  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.03 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.261602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
391 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.97 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0068  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.6 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.83 
 
 
835 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32360  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  27.86 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0067  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.88 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  31.38 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1370  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.03 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.329837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  30.09 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.15 
 
 
356 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.62 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.61 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0894  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.6 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  32.46 
 
 
836 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5251  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.92 
 
 
465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271448  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.45 
 
 
355 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>