More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1773 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  100 
 
 		 157 aa  321  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  69.23 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  45.16 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  43.87 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  51.77 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  41.29 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  41.29 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  41.29 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  43.84 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  40.69 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  38.85 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  41.84 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  39.6 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  36.91 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  38.46 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  40.14 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  36.36 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  40.3 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  38.73 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  36.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  38.81 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  39.84 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  39.84 
 
 		 198 aa  91.7  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  38.03 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  41.94 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  31.69 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.89 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  33.09 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  32.03 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  31.13 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  34.07 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  53.62 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0676  50S ribosomal protein L22  49.28 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0432957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  50 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  43.48 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  39.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  45.83 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  43.06 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  42.47 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  42.25 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  44.12 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  43.84 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  47.76 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  47.83 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  47.76 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  31.43 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  45.59 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  48.61 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf438  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0403  ribosomal protein L22  45.21 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  42.65 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>