84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1717 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  57.42 
 
 
217 aa  237  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  45.19 
 
 
221 aa  155  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  45.88 
 
 
221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  39.35 
 
 
236 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  50.86 
 
 
221 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  46.07 
 
 
221 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  38.81 
 
 
213 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  38.5 
 
 
216 aa  141  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  30.84 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  31.43 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  30.63 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.64 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  36.76 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  32.37 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  31.98 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  34.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  26.75 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  29.55 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  31.54 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  29.52 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  25.97 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  33.93 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  25.77 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  31.21 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  26.7 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  30.95 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  28.24 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  30.91 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  31.11 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  25.6 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  26.87 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  31.1 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  35.07 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  27.13 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.21 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  27.88 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  27.88 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  27.88 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  28.3 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  27.88 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  29.07 
 
 
241 aa  61.6  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  27.88 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1630  hypothetical protein  29.05 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  30.97 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  29.63 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  28.7 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  24.71 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  30.43 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.7 
 
 
793 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.59 
 
 
808 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0237  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
798 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.7 
 
 
847 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.93 
 
 
808 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.87 
 
 
847 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.23 
 
 
821 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.93 
 
 
817 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0162  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 
824 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.676244  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.93 
 
 
806 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 
803 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.94 
 
 
803 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.7 
 
 
801 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.157049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.76 
 
 
812 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.76 
 
 
807 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0797  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.76 
 
 
804 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.7 
 
 
834 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.58 
 
 
798 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 
859 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  30 
 
 
784 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0454  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.71 
 
 
800 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0047  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.76 
 
 
802 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2262  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.07 
 
 
795 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.283733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0618  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
825 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0228815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.43 
 
 
820 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2039  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.59 
 
 
804 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.67 
 
 
803 aa  42.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_004310  BR2123  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.59 
 
 
804 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.615312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0407  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.63 
 
 
805 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70562  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  33.33 
 
 
827 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  31.11 
 
 
866 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.66 
 
 
845 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1761  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.63 
 
 
805 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.36 
 
 
812 aa  41.6  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000701468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>