More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1455 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
444 aa  894    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  58.68 
 
 
443 aa  548  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  43.6 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  43.56 
 
 
491 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  45.37 
 
 
488 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  46.19 
 
 
444 aa  360  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  41.27 
 
 
468 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  41.32 
 
 
531 aa  342  9e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  42.25 
 
 
494 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  42.28 
 
 
451 aa  338  8e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  39.39 
 
 
466 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  42.54 
 
 
449 aa  333  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  41.72 
 
 
451 aa  330  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  39.39 
 
 
462 aa  329  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  40.41 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  38.6 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  41.51 
 
 
517 aa  326  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  40.8 
 
 
456 aa  324  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  40.41 
 
 
499 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  40.4 
 
 
509 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  40.8 
 
 
590 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  40.4 
 
 
509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  41.8 
 
 
470 aa  320  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  41.84 
 
 
451 aa  319  6e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  40.33 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  45.41 
 
 
440 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  36.3 
 
 
551 aa  239  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  39.2 
 
 
652 aa  226  7e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  37.02 
 
 
531 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  37.77 
 
 
654 aa  224  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  36.73 
 
 
650 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  35.48 
 
 
647 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  31.41 
 
 
630 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 
666 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.57 
 
 
550 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 
485 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  29.04 
 
 
551 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 
463 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 
485 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
590 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  27.86 
 
 
558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  28.97 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 
479 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 
548 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 
649 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.08 
 
 
479 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  27.48 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.45 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  28.76 
 
 
559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  29.07 
 
 
554 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.54 
 
 
558 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  27.99 
 
 
548 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 
561 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  27.72 
 
 
558 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 
549 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 
581 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.98 
 
 
550 aa  136  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.94 
 
 
602 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 
630 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  26.77 
 
 
548 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
633 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  27.48 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 
545 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.03 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 
550 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.76 
 
 
555 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  27.82 
 
 
555 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  27.78 
 
 
548 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.5 
 
 
548 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  27.74 
 
 
658 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  26.77 
 
 
546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  27.1 
 
 
838 aa  131  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  27.74 
 
 
557 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 
556 aa  130  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  27.82 
 
 
549 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  27.57 
 
 
549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  45.11 
 
 
886 aa  126  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  28.65 
 
 
951 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  27.43 
 
 
564 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  30.53 
 
 
464 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  27.07 
 
 
542 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  27.85 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  27.18 
 
 
818 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  29.06 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  24.68 
 
 
998 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.46 
 
 
720 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.25 
 
 
866 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  24.88 
 
 
781 aa  106  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 
706 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  28.43 
 
 
492 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  27.43 
 
 
698 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  27.94 
 
 
696 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  26.85 
 
 
707 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  27.52 
 
 
795 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  35.43 
 
 
796 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  35.8 
 
 
925 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>