47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1448 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1448  Phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 314 aa  638    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00994121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2166  hypothetical protein  50.17 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00217357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  31.37 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  33.55 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0069  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.844231  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  32.43 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  31.76 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  30.2 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  29.18 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  29.01 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0022  transcriptional regulator, XRE family  29.43 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55201  normal  0.925385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  29.14 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  28 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  25.5 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1221  hypothetical protein  29.61 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  32.95 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.63 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.7 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0564  hypothetical protein  32.4 
 
 		 179 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3238  hypothetical protein  28.73 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.112934  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1594  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.06 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  30.81 
 
 		 432 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1022  Phosphomethylpyrimidine kinase  31.85 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  27.55 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  31.71 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  31.52 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  29.94 
 
 		 452 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0944  phosphomethylpyrimidine kinase  33.13 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  27.32 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  33.8 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3501  hydroxymethylpyrimidine kinase  31.1 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1419  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  34.44 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  23.68 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2182  phosphomethylpyrimidine kinase  28.9 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0139  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  27.81 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0460  phosphomethylpyrimidine kinase  29.19 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0137  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  27.81 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1282  phosphomethylpyrimidine kinase  25.13 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2988  phosphomethylpyrimidine kinase  26.86 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0200  phosphomethylpyrimidine kinase  31.48 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.619111  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  30.82 
 
 		 445 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1311  hypothetical protein  38.24 
 
 		 78 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0919  phosphomethylpyrimidine kinase  39.34 
 
 		 127 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0491  phosphomethylpyrimidine kinase  33.73 
 
 		 446 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  32.03 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>