More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1372 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
913 aa  1835    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.11 
 
 
905 aa  1024    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 
916 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
916 aa  504  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.77 
 
 
912 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  30.81 
 
 
943 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  31.7 
 
 
939 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.84 
 
 
915 aa  487  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.01 
 
 
927 aa  487  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.05 
 
 
932 aa  484  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
926 aa  477  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.48 
 
 
928 aa  479  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.61 
 
 
946 aa  475  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.6 
 
 
944 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.69 
 
 
937 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  31.65 
 
 
954 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  31.91 
 
 
955 aa  465  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 
928 aa  462  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  32.25 
 
 
903 aa  459  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.64 
 
 
972 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
946 aa  451  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 
897 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 
903 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
970 aa  433  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 
913 aa  436  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  31.13 
 
 
898 aa  429  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 
909 aa  429  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.24 
 
 
890 aa  411  1e-113  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  33.49 
 
 
1688 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  31.21 
 
 
874 aa  272  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  30.69 
 
 
874 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  30.25 
 
 
914 aa  271  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  29.97 
 
 
1480 aa  270  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  30.69 
 
 
874 aa  270  8e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  27.27 
 
 
1567 aa  270  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  30.04 
 
 
888 aa  269  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  27.28 
 
 
875 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  29.66 
 
 
915 aa  266  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
1476 aa  264  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.63 
 
 
933 aa  262  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
931 aa  262  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  31.63 
 
 
873 aa  261  5.0000000000000005e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
1497 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  28.02 
 
 
1504 aa  259  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  30.09 
 
 
872 aa  259  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  29.34 
 
 
872 aa  258  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  29.68 
 
 
922 aa  257  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.3 
 
 
824 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  30.12 
 
 
1534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.05 
 
 
1523 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.66 
 
 
1534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
1523 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.2 
 
 
1523 aa  255  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  28.28 
 
 
1584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.3 
 
 
1510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  26.71 
 
 
1388 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  27.94 
 
 
1435 aa  254  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  27.54 
 
 
1513 aa  252  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.34 
 
 
1412 aa  251  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  27.9 
 
 
1535 aa  250  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  30.1 
 
 
1536 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  26.02 
 
 
1573 aa  250  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
900 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  26.47 
 
 
1544 aa  249  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  26.95 
 
 
1448 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  29.81 
 
 
1536 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  27.36 
 
 
1448 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.15 
 
 
870 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.85 
 
 
1429 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.42 
 
 
1505 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.9 
 
 
1700 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.25 
 
 
1508 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.31 
 
 
1506 aa  247  8e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  26.43 
 
 
1632 aa  247  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  29.35 
 
 
1515 aa  247  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 
1518 aa  247  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
1480 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  29.9 
 
 
1599 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.9 
 
 
1598 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.9 
 
 
1598 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  29.9 
 
 
1598 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  29.9 
 
 
1598 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  29.84 
 
 
1536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.9 
 
 
1598 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
1553 aa  245  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
1517 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.24 
 
 
1613 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.55 
 
 
1626 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
1514 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.89 
 
 
1516 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  27.4 
 
 
1434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  26.69 
 
 
1493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.77 
 
 
1475 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  26.79 
 
 
1431 aa  241  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 
1539 aa  241  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1426 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.4 
 
 
806 aa  240  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
819 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  26.71 
 
 
1419 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.44 
 
 
801 aa  238  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.536438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>