More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1246 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
356 aa  704  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  58.91 
 
 
350 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  34.12 
 
 
372 aa  202  1e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  33.04 
 
 
385 aa  201  2e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  37.35 
 
 
409 aa  201  2e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  33.63 
 
 
381 aa  190  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  32.94 
 
 
403 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  36.99 
 
 
424 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  32.35 
 
 
461 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.56343e-05  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  34.42 
 
 
405 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  35.14 
 
 
450 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  34.78 
 
 
450 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  31.23 
 
 
450 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  33.22 
 
 
436 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  32.26 
 
 
454 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  33.11 
 
 
428 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  33.89 
 
 
433 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  35.16 
 
 
503 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  33.89 
 
 
433 aa  156  5e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  33.89 
 
 
433 aa  156  5e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0658  GTP-binding protein HflX  36.05 
 
 
447 aa  156  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  32.04 
 
 
436 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  31.78 
 
 
413 aa  155  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  32.11 
 
 
433 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  36.93 
 
 
405 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  31.32 
 
 
382 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  31.67 
 
 
454 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  33.67 
 
 
540 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  32.31 
 
 
574 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  33.73 
 
 
412 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  35.82 
 
 
420 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  33.76 
 
 
441 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  33.22 
 
 
432 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  32.29 
 
 
434 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  32.14 
 
 
517 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  29.82 
 
 
553 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  34.82 
 
 
509 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  32.33 
 
 
401 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  31.92 
 
 
414 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  33.66 
 
 
512 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  29.82 
 
 
512 aa  149  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.1 
 
 
486 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  31.7 
 
 
417 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  38.29 
 
 
413 aa  148  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  30.72 
 
 
442 aa  149  1e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  38.43 
 
 
582 aa  149  1e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  31.23 
 
 
435 aa  147  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  30.53 
 
 
564 aa  148  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  30.98 
 
 
433 aa  147  2e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  31.64 
 
 
414 aa  148  2e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  30.53 
 
 
564 aa  147  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  30.66 
 
 
441 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  34.64 
 
 
485 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  34.63 
 
 
406 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  30.79 
 
 
435 aa  147  4e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  30.79 
 
 
435 aa  147  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  33.14 
 
 
371 aa  146  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  32.23 
 
 
444 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  33.43 
 
 
372 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  31 
 
 
429 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  36.14 
 
 
395 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  33.87 
 
 
493 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  31.79 
 
 
429 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  6.08691e-12 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1065  GTP-binding proten HflX  31.61 
 
 
417 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  30.79 
 
 
433 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  34.62 
 
 
403 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  6.5557e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  31.29 
 
 
435 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  30.79 
 
 
433 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  30.81 
 
 
395 aa  143  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  32.78 
 
 
434 aa  143  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  29.41 
 
 
435 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  32.27 
 
 
535 aa  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  32.73 
 
 
403 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  36.55 
 
 
370 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 
439 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  31.36 
 
 
422 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.12987e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1157  GTP-binding proten HflX  31.31 
 
 
417 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  28.86 
 
 
435 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.9061e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  33.43 
 
 
596 aa  142  1e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  33.86 
 
 
419 aa  142  1e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.03435e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  30.75 
 
 
406 aa  142  1e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  32.79 
 
 
433 aa  142  1e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  34.25 
 
 
425 aa  142  1e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  32.26 
 
 
429 aa  141  2e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.59 
 
 
436 aa  140  2e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1623  GTP-binding proten HflX  32.83 
 
 
408 aa  141  2e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2283  GTP-binding proten HflX  32.62 
 
 
549 aa  141  2e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  30.59 
 
 
435 aa  141  2e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  2.15533e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  29.86 
 
 
435 aa  141  2e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  29.95 
 
 
425 aa  141  2e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  31.25 
 
 
407 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  35.59 
 
 
414 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.53 
 
 
493 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  30.38 
 
 
409 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  31.15 
 
 
441 aa  140  4e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  28.79 
 
 
431 aa  140  4e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0216  GTP-binding proten HflX  31.42 
 
 
607 aa  140  4e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  32.88 
 
 
458 aa  140  4e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0227  GTP-binding proten HflX  31.42 
 
 
607 aa  140  4e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.160426  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  32.14 
 
 
431 aa  140  4e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>