208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1159 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  53.47 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  33.18 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  27.05 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  27.18 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  27.67 
 
 		 283 aa  89.4  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  26.92 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  30 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  29.32 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  28.8 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  29.84 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  29.23 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  28.14 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.89 
 
 		 626 aa  78.2  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  24.06 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  23.94 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2248  siroheme synthase  27.27 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0893363  normal  0.464998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.42 
 
 		 480 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  26.56 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  27.13 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  24.89 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  20.85 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  24.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  24.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  24.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  24.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  24.43 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.15 
 
 		 480 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  29.82 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  24.43 
 
 		 457 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  28.57 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  23.83 
 
 		 459 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  25.89 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  22.68 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  29.5 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  23.98 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  30.06 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  22.68 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  22.68 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  22.68 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  24.34 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  25.27 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  31.76 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.41 
 
 		 472 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  23.81 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  23.81 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  23.81 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  26.18 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  23.08 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  23.08 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  23.08 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  23.08 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  21.4 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  30.56 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  28.87 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  22.62 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  30 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  30.37 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.34 
 
 		 487 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  25.54 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  24.64 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.33 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  27.54 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  30 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  26.87 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  27.14 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.81 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  25.67 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  30.71 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  26.49 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  21.13 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  22.95 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  21.13 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  29.24 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  24.52 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  24.52 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  25 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.5 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.08 
 
 		 528 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  23.6 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  25.13 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  27.33 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  28.37 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  22.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  28.19 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  25.43 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  26.57 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  20.09 
 
 		 457 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  27.66 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  26.95 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.04 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  25 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  23.96 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  29.82 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  27.74 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.37 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.32 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  24.83 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0053  siroheme synthase  27.51 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000804715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>