84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1068 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 
130 aa  258  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  72.8 
 
 
125 aa  196  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  60 
 
 
151 aa  158  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  59.2 
 
 
153 aa  157  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  59.84 
 
 
169 aa  157  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  54.47 
 
 
128 aa  150  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  59.02 
 
 
122 aa  149  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  57.26 
 
 
120 aa  148  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  67.46 
 
 
129 aa  148  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  55.74 
 
 
122 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  53.66 
 
 
122 aa  140  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  55.46 
 
 
122 aa  139  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  52.99 
 
 
120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  57.98 
 
 
121 aa  137  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  54.7 
 
 
120 aa  135  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  50.83 
 
 
164 aa  135  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  52.99 
 
 
117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  53.45 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  60.16 
 
 
149 aa  133  9e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  52.59 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  51.69 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  50.42 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  53.33 
 
 
117 aa  128  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  50.85 
 
 
122 aa  127  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  55.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  55.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  55.46 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  53.78 
 
 
136 aa  123  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  40.74 
 
 
127 aa  94.7  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  44.83 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  46.84 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  33.87 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  47 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  36.36 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  43.68 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.39 
 
 
254 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  31.73 
 
 
224 aa  62  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.48 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  46.38 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.78 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.78 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  29.13 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  31.78 
 
 
225 aa  58.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.93 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.54 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  46.38 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.02 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  45.07 
 
 
266 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  39.29 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  46.43 
 
 
253 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  41.18 
 
 
261 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  37.84 
 
 
259 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  39.29 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  33.68 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.68 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  32.58 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  38.46 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  41.94 
 
 
264 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  42.03 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  34.44 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  35.29 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  40 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91009  predicted protein  38.1 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.79 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  32.35 
 
 
215 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  39.39 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.82 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  35.63 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  40.58 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  31.91 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  30.68 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  30.85 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04073  40S ribosomal protein S12 (Broad)  36.07 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.713259  normal  0.323926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.78 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  31.11 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03760  40S ribosomal protein S12, putative  28.4 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0567  putative ribosomal protein L7Ae-like  34.78 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000530013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  31.91 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0581  putative ribosomal protein L7Ae-like  34.78 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00254265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  30.11 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  33.33 
 
 
79 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  33.33 
 
 
79 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>