More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1054 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  60.67 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  65.56 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  52.2 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  52.15 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  49.69 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  49.08 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  50.31 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  49.08 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  48.17 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  50.6 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  50.62 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  45.03 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  48.39 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  47.62 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  41.81 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  47.59 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  45.83 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  48.3 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  48.65 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  49.03 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  49.03 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  44.44 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  46.34 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  46.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  47.1 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  43.87 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  39.38 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  39.38 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  41.88 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.6 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  35.16 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  62 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  42.22 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  57.14 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  43.59 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  49.09 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  51.02 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  31.3 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  31.3 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  40.26 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  43.37 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  40.54 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  41.38 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  41.77 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  43.42 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  53.06 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  40 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  41.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  37.08 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  40.96 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  53.06 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  51.85 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  41.03 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  51.02 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  42.62 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  35.23 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  43.64 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  39.78 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.06 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  27.78 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  54.76 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  46.55 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>