More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0923 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  60.77 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.29 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.12 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.76 
 
 		 304 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.58 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  32.46 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.71 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.34 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.34 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  34.31 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.54 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  31.08 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.37 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.21 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.17 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25.55 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.63 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  27.69 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.37 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.06 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.86 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  25 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  27.94 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  24.82 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.43 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  27.86 
 
 		 313 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  26.56 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.14 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  25.9 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  30.57 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.34 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  27.97 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  29.68 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  42.59 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 287 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  27.14 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  26.43 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.5 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74592  universal stress protein (USP) family protein possible involvement in nucleo-mitochondrial control of maltose, galactose and raffinose utilization  48.94 
 
 		 480 aa  50.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.78 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.78 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  30.43 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  25.37 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  46.94 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.35 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  27.27 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  27.66 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.74 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  27.74 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  23.74 
 
 		 313 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.41 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  35.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  25.87 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  47.17 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  25.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.58 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  24.46 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.56 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  37.1 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  38.6 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  25.53 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.47 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>