More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0914 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  42.75 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  45 
 
 
128 aa  100  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  46.43 
 
 
142 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  37.4 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.23 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.64 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  42.74 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.31 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  41.18 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  42.15 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  38.46 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  40.32 
 
 
138 aa  94  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  39.67 
 
 
130 aa  93.2  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  40.16 
 
 
139 aa  93.2  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  39.23 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  38.98 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.52 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  39.83 
 
 
688 aa  90.5  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  42.37 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  41.38 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 
688 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 
643 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  41.32 
 
 
136 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  42.34 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  41.38 
 
 
145 aa  87  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  39.32 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  43.59 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  38.79 
 
 
486 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  40.98 
 
 
188 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  35.71 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  37.19 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  37.93 
 
 
141 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  40.52 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  36.07 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 
638 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  36.57 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  37.4 
 
 
645 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  34.92 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  40.87 
 
 
618 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  38.21 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.67 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  35.88 
 
 
644 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 
663 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  39.81 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  38.98 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  35.11 
 
 
622 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  39.5 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.84 
 
 
625 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
625 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  42.02 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  39.83 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  40 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  37.84 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  41.44 
 
 
242 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  36.43 
 
 
606 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  31.93 
 
 
145 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  34.45 
 
 
644 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.29 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  36.94 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  36.04 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.79 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  39.55 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  33.04 
 
 
646 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  32.82 
 
 
646 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.4 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  32.82 
 
 
645 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  41.53 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  38.14 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  30.7 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  36.52 
 
 
629 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  37.29 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  42.4 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
688 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  37.61 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.52 
 
 
660 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.6 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  37.72 
 
 
637 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
645 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 
625 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  35.9 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  36.89 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  40.54 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.45 
 
 
650 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
623 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.83 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  36.7 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>