More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0906 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 159 aa  326  7e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0079  NUDIX hydrolase  44.06 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.886246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1011  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000869089 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2205  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.453063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0855  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 211 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2953  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  27.88 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  30.23 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  29.11 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  31.65 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  31.65 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 238 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  29.45 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  27.16 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  27.98 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 226 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  31.52 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  28.32 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  27.06 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  26.54 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  27.39 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  27.39 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  27.39 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 198 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 241 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.89 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  25.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  25.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  27.67 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  26.28 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 226 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3159  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  26.19 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 243 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  26.01 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>