More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0813 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 302 aa  607  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  46.28 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.48 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  29.33 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.53 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1812  dihydrodipicolinate synthetase  32.02 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.973565  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0309  dihydrodipicolinate synthetase  32.41 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.29 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 		 371 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  33 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  30.83 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  35.59 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0350  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  34.86 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  29.48 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.64 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.6 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  28.36 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.8 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  32.02 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  32.02 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0120  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.380726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>